以文山三七研究院为主开展的三七科研工作不断向前推进。2009年上半年，文山三七研究院共实施在研科技项目11项，其中：国家科技部“十一五”科技支撑计划项目（子项目）4项，省科技厅应用基础研究项目4项，上海静安区科协协作项目1项，文山州科技局项目1项，文山县科技局科研项目1项。
    三七连作障碍研究项目2009年1月获得了省科技厅的立项支持，承担该项目的文山三七研究院联合云南师范大学能源与环境科学研究所、云南省农科院药用植物研究所、中国中医科学院中药研究所4家单位共同开展研究工作。半年来，已对老七地连作障碍机理、连茬剂筛选探索性试验、种植三七地块不同植物的轮作体系、三七话感物质及三七毒害作用等方面进行了初步探索和试验，并取得了一定的经验和成效。
    在三七地上部分资源综合开发利用研究方面，文山三七研究院开展了几个层次的研究，一是生产工艺的研究，按照国家《保健食品管理方法》、《新资源食品管理方法》及《新资源食品研制报告指导原则》完成了三七茎叶、三七花新资源食品及保健食品部分生产工艺相关技术研究；二是质量标准的研究，按照食品卫生标准的要求，研究确定了三七茎叶、三七花的性状、灰分、酸不溶性灰分、水分及各项卫生指标，目前正在进行功能性成分皂苷含量的检测研究工作。三是食品安全性评价研究，按《新资源食品管理办法》目前正在进行急性毒性试验、三项致突变试验、90天口毒性试验和致畸等毒理学试验。
    在抓好在研科技项目的同时，上半年，文山三七研究院向国家自然基金委员会申请了《三七黑斑病、圆斑病生态防改善机制研究》项目，向省科技厅申请《三七有效部位P1237》软胶囊五类抗肝癌新药临床前预研究》项目、《三七抗病优质品种选育及主要病虫害综合防改善技术研究》、《三七多倍体诱导及鉴定技术研究》等12项。