1、选择适宜地块。最适宜种植三七的土壤为砂壤土，PH值为6—7（中偏微酸性土壤）。地块要有一定坡度，以利雨季排水；不要选择5年内种过三七的地块种植。
2、选择健康种苗移栽。种苗带菌或起挖后贮藏时间过长，是导致根腐的一大原因，因此，选择健康种苗，适时移栽非常重要。健康种苗的选择还要查看种苗中是否有腐烂病株，种苗地是否有病株残体存在，如有应及时清除，并用1∶300倍的瑞毒霉锰锌+甲基托布津或多菌灵进行种苗处理30分钟后带药移栽。
3、施用腐熟肥料、适时浇灌。施用未充分腐熟的农家肥是造成烂根烂芽的原因之一。因此若是用猪粪、油枯等农家肥，一定要堆沤3个月以上，使之充分腐熟，少施用氮素化肥。
4、加强冬季管理。及时清除病残体并进行消毒处理，可用多菌灵、瑞毒霉锰锌1∶500倍液处理。
5、化学防改善。是防改善三七根腐病的辅助性措施，可采用杀细菌药剂叶枯净、叶枯宁和杀真菌药剂敌克松、多菌灵等复配使用。据试验：每亩用10％叶枯净（叶枯宁）+70％敌克松各1公斤制成药土撒施，防效达70％以上。
